Hvidløg er et strengformet lavt rodsystem uden en hovedrod. Hovedrodgruppen er fordelt i jordlaget inden for 5-25 cm med en vandret diameter på 30 cm. Med hensyn til plantemorfologi udvikler selve pæren sig fra metamorfe grene, og dens internoder forkortes til" pæreskiver". Basen og kanterne på stilkeskiverne er rodfæstet med rødder, hvorpå blade og knopper er primitive. Efter differentiering af blomsterknopper danner de apikale knopper blomsterstængler, og de laterale knopper udvides til dannelse af hvidløgsfed. Reproduktionsmetoden for hvidløg er aseksuel reproduktion, og reproduktionsorganet er en lateral knopp på moderens' s krop, nemlig skala knoppen. En voksen hvidløgsplante består af rødder, pseudostænger, blade, stilke, løg osv.
Hvidløgens blade inkluderer bladlegeme og bladskede. Bladskeden er rørformet og vokser i en ring på stammen. Flerlagsbladskederne krammer hinanden for at danne en pseudostamme, der har funktionen af mekanisk støtte og levering af næringsstoffer til pæren.
